वनस्पती रोग महामारीशास्त्र म्हणजे वनस्पतींच्या लोकसंख्येतील रोगाचा अभ्यास. मानवाच्या आणि इतर प्राण्यांच्या आजारांप्रमाणेच, रोगांचे विषाणू बॅक्टेरिया, विषाणू, बुरशी, ऑमासिटेस, नेमाटोड्स, फायटोप्लाझ्मा, प्रोटोझोआ आणि परजीवी वनस्पती अशा रोगजनकांमुळे उद्भवतात. रोगाचा रोग महामारीशास्त्रज्ञ रोगाचे कारण आणि त्याचे परिणाम समजून घेण्यासाठी प्रयत्न करतात आणि जेथे पीक नुकसान होऊ शकते अशा परिस्थितीत हस्तक्षेप करण्याचे धोरण विकसित करतात. सामान्यत: यशस्वी हस्तक्षेपामुळे पिकाच्या किंमतीवर अवलंबून रोग कमी प्रमाणात कमी होतो.
बहुधा शास्त्रीय दृष्टिकोनातून वनस्पती रोग महामारी विज्ञानकडे पाहिले जाते, ज्यामध्ये जैविक, सांख्यिकीय, कृषीशास्त्र आणि पर्यावरणीय दृष्टीकोन आवश्यक असतात. रोगजनक आणि त्याचे जीवन चक्र समजण्यासाठी जीवशास्त्र आवश्यक आहे. पिकाचे शरीरशास्त्र आणि रोगजनकांचा त्याचा विपरित परिणाम कसा होतो हे समजून घेणे देखील आवश्यक आहे. कृषीविषयक पद्धती बर्याचदा चांगल्या किंवा वाईट गोष्टींसाठी रोगाचा प्रादुर्भाव करतात. पर्यावरणीय प्रभाव असंख्य आहेत. मूळ वनस्पतींचे प्राणी रोगजनकांच्या रोगांचे जलाशय म्हणून काम करतात ज्यामुळे पिकांमध्ये रोग होतो. सांख्यिकीय मॉडेल्स बहुतेक वेळा सारांश लावण्यासाठी आणि वनस्पती रोग महामारीविज्ञानाच्या जटिलतेचे वर्णन करण्यासाठी वापरल्या जातात, जेणेकरुन रोग प्रक्रिया अधिक सहजपणे समजून घेता येतील. उदाहरणार्थ, रोगांचे रोग, प्रगती, व्यवस्थापन धोरण किंवा पर्यावरणीय संयोजनांसाठी रोगाच्या प्रगतीच्या नमुन्यांची तुलना वनस्पतींच्या रोगांचे सर्वोत्तम व्यवस्थापन कसे करता येईल हे ठरविण्यात मदत करते. रोग उद्भवणार्या स्त्रोतांकडून आयात करण्यावर निर्बंध यासारख्या कृतीद्वारे रोग होण्याच्या घटनांमध्ये धोरण प्रभावी ठरू शकते.